Để khai thác hết tính năng của phần mềm Autorun Eater, ta nhấn phải chuột vào biểu tượng này và chọn tiếp một trong các lịnh sau: 
Scan Drive A/B [quét virus autorun trên đĩa mềm]. 
Pause/Unpause [tắt/mở tính năng kiểm tra tự động của chương trình]. 
Scan Priority [chọn mức ưu tiên khi kiểm tra là Normal hoặc High]. 
Autorun Backup [xem các file lạ bị xóa ở đây và khôi phục lại nếu cảm thấy chúng an toàn], Scan Results [thông báo kết quả các đợt kiểm tra file autorun.inf của chương trình]. 
Remove Billy From System Startup [không cho chương trình tự động kích hoạt khi vào Windows]. 
Add Billy To System Startup [cho phép chương trình tự động kick hoạt khi vào Windows]. 
Ngoài ra, chương trình còn cung cấp tính năng Registry Fix giúp ta sửa chữa một số lỗi thường gặp khi máy bị nhiễm virus autorun như: 
Fix Task Manager [cho hiện lại Task Manager]. 
Fix Regedit [cho hiện lại Registry Editor]. 
Fix Folder Options [cho hiện lại hộp thoại Folder Options].

- Nếu không tải được phần mềm AE thì bạn hãy dùng đĩa LHT mới nhất mua ở ngoài cửa hàng chỉ có 10.000đvn , và dùng nó quét diệt virus từ trong dos, safe mode sẽ hiệu quả hơn [chú ý nhớ tắt kết nối internet, tắt system restore trước khi diệt virus]. Đồng thời mở folder options trong Control Panel chọn views > show all file và hủy chọn hide protected operating system file. Tiếp đến dò tìm các ổ cứng và xóa hoàn toàn [nhấn shift+delete] các file autorun.inf và page.pif Tiếp theo mở Msconfig > startup, hủy chọn các chương trình khởi động có dạng ~exe~1.exe đi. Sau đó khởi động lại máy và quét virus toàn bộ lần hai, và tắt ngắt nguồn điện ra khỏi máy chờ khoảng 30 phút sau. Sau khi diệt virus lần hai khi khởi động máy lại, nếu nó hiện bảng thông báo không tìm thấy file…exe gì đó. Tình trạng này là do các file nhiễm virus đã bị chương trinh diệt virus xóa nhưng các lệnh kích hoạt chúng thì vẫn tồn tại . Do vậy ta hãy xóa các lệnh này bằng cách nhấn menu Start mở hộp Run, gõ regedit > Enter. Cửa sổ hiện ra, trong khung bên trái, clip trỏ phải lên hàng chữ HKEY_CLASSES_ROOT, gõ tên file…exe [xuất hiện trong bảng cảnh báo…] vào ô trống trong cửa sổ hiện ra và bấm Enter, khi cửa sổ này mất đi, bấm phím F3 để nhảy hàng chữ chứa lệnh kích hoạt file…exe trong khung bên phải, bấm phím Delete để xóa lệnh này, sau đó bấm phím F3 để tìm và xóa tất cả các lệnh liên quan tới file virus...exe. Ngoài ra cũng có thể dùng HijackThis http://www.pcworld.com/downloads/file/fi… để xoá các khoá và các process đang chạy.

- Sau khi diệt virus bạn có thể thực hiện bằng cách nhấn menu Start > mở hộp Run gõ gpedit.msc nhấn Enter .Ở cửa sổ Group Policy settings, chọn User Configuration > Administrative Templates > System > Chọn Options Ctrl+Alt+Delete > Chọn Remove Task Manager. Nhấn đúp chuột vào vào mục Remove Task Manager và chọn Disable. Đồng thời nhấn menu Start mở Run gõ GPUPDATE / FORCE nhấn Enter. 
Bạn tiếp tục nhấn menu Start > mở hộp Run gõ gpedit.msc và nhấn Enter. Trong giao diện công cụ Group Policy > nhấn thẻ User Configuration > Administrative Templates > System > Prevent acceess to registry editing tools > Properties, cửa sổ Prevent access to registry editing tools Properties hiện ra , ta click chọn vào Enabled thì thanh khung hiện ra màu trắng có chữ No thì ta chỉnh nó thành Yes và click vào Apply ta lại tiếp tục click chọn vào chữ Not Configured và nhấp OK. Sau khi thao tác xong thì khởi động máy lại để thay đổi có hiệu lực.
- Hoặc sau khi diệt sạch virus bạn có thể dùng phần mềm Fast Unlock Kool (FUK) giúp bạn dễ dàng khôi phục các chức năng bị khoá trong Windows http://www.download.com.vn/internet+emai… 
Chú ý: bạn phải diệt sạch virus thì mới có thể tải phần mềm FUK được. Nếu có tải về được thì cũng chẳng sử dụng được vì virus đã phá hủy file chạy của FUK, do đó bạn hãy gỡ bỏ FUK và tiến hành diệt virus trước đã rồi sau đó mới có thể tải FUK bạn nhé!